Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms