Protein–RNA interactions for Protein: Q02297

NRG1, Pro-neuregulin-1, membrane-bound isoform, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRG1Q02297 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NRG1Q02297 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NRG1Q02297 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NRG1Q02297 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NRG1Q02297 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NRG1Q02297 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NRG1Q02297 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
NRG1Q02297 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NRG1Q02297 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NRG1Q02297 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NRG1Q02297 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NRG1Q02297 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NRG1Q02297 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NRG1Q02297 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NRG1Q02297 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NRG1Q02297 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NRG1Q02297 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NRG1Q02297 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NRG1Q02297 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NRG1Q02297 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NRG1Q02297 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NRG1Q02297 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NRG1Q02297 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NRG1Q02297 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NRG1Q02297 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NRG1Q02297 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NRG1Q02297 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NRG1Q02297 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NRG1Q02297 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NRG1Q02297 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NRG1Q02297 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NRG1Q02297 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NRG1Q02297 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
NRG1Q02297 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NRG1Q02297 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NRG1Q02297 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
NRG1Q02297 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NRG1Q02297 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NRG1Q02297 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NRG1Q02297 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
NRG1Q02297 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NRG1Q02297 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NRG1Q02297 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NRG1Q02297 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NRG1Q02297 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NRG1Q02297 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NRG1Q02297 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NRG1Q02297 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NRG1Q02297 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NRG1Q02297 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NRG1Q02297 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NRG1Q02297 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NRG1Q02297 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NRG1Q02297 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NRG1Q02297 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NRG1Q02297 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NRG1Q02297 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NRG1Q02297 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NRG1Q02297 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NRG1Q02297 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NRG1Q02297 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NRG1Q02297 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NRG1Q02297 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NRG1Q02297 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NRG1Q02297 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NRG1Q02297 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
NRG1Q02297 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NRG1Q02297 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NRG1Q02297 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NRG1Q02297 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
NRG1Q02297 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NRG1Q02297 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NRG1Q02297 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NRG1Q02297 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NRG1Q02297 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NRG1Q02297 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NRG1Q02297 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NRG1Q02297 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NRG1Q02297 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NRG1Q02297 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
NRG1Q02297 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NRG1Q02297 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NRG1Q02297 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NRG1Q02297 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NRG1Q02297 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NRG1Q02297 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NRG1Q02297 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NRG1Q02297 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NRG1Q02297 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NRG1Q02297 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NRG1Q02297 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NRG1Q02297 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NRG1Q02297 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NRG1Q02297 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NRG1Q02297 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NRG1Q02297 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NRG1Q02297 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NRG1Q02297 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NRG1Q02297 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NRG1Q02297 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms