Protein–RNA interactions for Protein: Q00325

SLC25A3, Phosphate carrier protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A3Q00325 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC25A3Q00325 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC25A3Q00325 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC25A3Q00325 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC25A3Q00325 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC25A3Q00325 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC25A3Q00325 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC25A3Q00325 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC25A3Q00325 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC25A3Q00325 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC25A3Q00325 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC25A3Q00325 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC25A3Q00325 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC25A3Q00325 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC25A3Q00325 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC25A3Q00325 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC25A3Q00325 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC25A3Q00325 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC25A3Q00325 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC25A3Q00325 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC25A3Q00325 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC25A3Q00325 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC25A3Q00325 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC25A3Q00325 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC25A3Q00325 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC25A3Q00325 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC25A3Q00325 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC25A3Q00325 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC25A3Q00325 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC25A3Q00325 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC25A3Q00325 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC25A3Q00325 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC25A3Q00325 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC25A3Q00325 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC25A3Q00325 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC25A3Q00325 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC25A3Q00325 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC25A3Q00325 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC25A3Q00325 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC25A3Q00325 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC25A3Q00325 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC25A3Q00325 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC25A3Q00325 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC25A3Q00325 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC25A3Q00325 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC25A3Q00325 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC25A3Q00325 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC25A3Q00325 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC25A3Q00325 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC25A3Q00325 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC25A3Q00325 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC25A3Q00325 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC25A3Q00325 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC25A3Q00325 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC25A3Q00325 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC25A3Q00325 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC25A3Q00325 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC25A3Q00325 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC25A3Q00325 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC25A3Q00325 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC25A3Q00325 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC25A3Q00325 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC25A3Q00325 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC25A3Q00325 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC25A3Q00325 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC25A3Q00325 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC25A3Q00325 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC25A3Q00325 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC25A3Q00325 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC25A3Q00325 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC25A3Q00325 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC25A3Q00325 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC25A3Q00325 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC25A3Q00325 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLC25A3Q00325 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLC25A3Q00325 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLC25A3Q00325 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLC25A3Q00325 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLC25A3Q00325 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLC25A3Q00325 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLC25A3Q00325 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLC25A3Q00325 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC25A3Q00325 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC25A3Q00325 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC25A3Q00325 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC25A3Q00325 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC25A3Q00325 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC25A3Q00325 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC25A3Q00325 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC25A3Q00325 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC25A3Q00325 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC25A3Q00325 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC25A3Q00325 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC25A3Q00325 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC25A3Q00325 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC25A3Q00325 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC25A3Q00325 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC25A3Q00325 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC25A3Q00325 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC25A3Q00325 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms