Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNB1P98172 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms