Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 ADAMTS5-201ENST00000284987 9056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC12.07□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 PRDM16-201ENST00000270722 8690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC12.06□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 DAAM2-202ENST00000398904 6224 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 POU2F2-202ENST00000389341 6901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms