Protein–RNA interactions for Protein: P49335

POU3F4, POU domain, class 3, transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU3F4P49335 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
POU3F4P49335 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
POU3F4P49335 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.03■□□□□ -0
POU3F4P49335 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
POU3F4P49335 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
POU3F4P49335 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
POU3F4P49335 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
POU3F4P49335 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
POU3F4P49335 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.03■□□□□ -0
POU3F4P49335 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
POU3F4P49335 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
POU3F4P49335 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
POU3F4P49335 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
POU3F4P49335 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
POU3F4P49335 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
POU3F4P49335 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
POU3F4P49335 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
POU3F4P49335 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
POU3F4P49335 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
POU3F4P49335 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
POU3F4P49335 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
POU3F4P49335 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
POU3F4P49335 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
POU3F4P49335 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
POU3F4P49335 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
POU3F4P49335 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
POU3F4P49335 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
POU3F4P49335 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
POU3F4P49335 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
POU3F4P49335 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
POU3F4P49335 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
POU3F4P49335 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
POU3F4P49335 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
POU3F4P49335 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
POU3F4P49335 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
POU3F4P49335 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
POU3F4P49335 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
POU3F4P49335 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
POU3F4P49335 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
POU3F4P49335 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
POU3F4P49335 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.02■□□□□ -0
POU3F4P49335 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.02■□□□□ -0
POU3F4P49335 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
POU3F4P49335 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.02■□□□□ -0
POU3F4P49335 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
POU3F4P49335 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.02■□□□□ -0
POU3F4P49335 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
POU3F4P49335 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.02■□□□□ -0
POU3F4P49335 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
POU3F4P49335 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
POU3F4P49335 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
POU3F4P49335 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
POU3F4P49335 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
POU3F4P49335 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
POU3F4P49335 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
POU3F4P49335 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
POU3F4P49335 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
POU3F4P49335 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
POU3F4P49335 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
POU3F4P49335 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
POU3F4P49335 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
POU3F4P49335 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
POU3F4P49335 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
POU3F4P49335 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
POU3F4P49335 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
POU3F4P49335 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
POU3F4P49335 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
POU3F4P49335 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
POU3F4P49335 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
POU3F4P49335 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
POU3F4P49335 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
POU3F4P49335 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
POU3F4P49335 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
POU3F4P49335 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
POU3F4P49335 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
POU3F4P49335 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
POU3F4P49335 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
POU3F4P49335 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
POU3F4P49335 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
POU3F4P49335 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
POU3F4P49335 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
POU3F4P49335 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
POU3F4P49335 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
POU3F4P49335 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
POU3F4P49335 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
POU3F4P49335 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
POU3F4P49335 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
POU3F4P49335 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
POU3F4P49335 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
POU3F4P49335 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
POU3F4P49335 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
POU3F4P49335 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
POU3F4P49335 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
POU3F4P49335 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
POU3F4P49335 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
POU3F4P49335 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
POU3F4P49335 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
POU3F4P49335 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
POU3F4P49335 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
POU3F4P49335 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms