Protein–RNA interactions for Protein: P43354

NR4A2, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A2P43354 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms