Protein–RNA interactions for Protein: P13765

HLA-DOB, HLA class II histocompatibility antigen, DO beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOBP13765 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HLA-DOBP13765 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-DOBP13765 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms