Protein–RNA interactions for Protein: P11836

MS4A1, B-lymphocyte antigen CD20, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A1P11836 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MS4A1P11836 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MS4A1P11836 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MS4A1P11836 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MS4A1P11836 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MS4A1P11836 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MS4A1P11836 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MS4A1P11836 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MS4A1P11836 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MS4A1P11836 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MS4A1P11836 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MS4A1P11836 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MS4A1P11836 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MS4A1P11836 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MS4A1P11836 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MS4A1P11836 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MS4A1P11836 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MS4A1P11836 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MS4A1P11836 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MS4A1P11836 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MS4A1P11836 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MS4A1P11836 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MS4A1P11836 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
MS4A1P11836 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MS4A1P11836 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MS4A1P11836 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MS4A1P11836 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MS4A1P11836 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MS4A1P11836 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MS4A1P11836 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MS4A1P11836 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
MS4A1P11836 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MS4A1P11836 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MS4A1P11836 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MS4A1P11836 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MS4A1P11836 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MS4A1P11836 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MS4A1P11836 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MS4A1P11836 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MS4A1P11836 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MS4A1P11836 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MS4A1P11836 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MS4A1P11836 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MS4A1P11836 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MS4A1P11836 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MS4A1P11836 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MS4A1P11836 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MS4A1P11836 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MS4A1P11836 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MS4A1P11836 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MS4A1P11836 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MS4A1P11836 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MS4A1P11836 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MS4A1P11836 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MS4A1P11836 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MS4A1P11836 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MS4A1P11836 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MS4A1P11836 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MS4A1P11836 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MS4A1P11836 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MS4A1P11836 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MS4A1P11836 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MS4A1P11836 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MS4A1P11836 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MS4A1P11836 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MS4A1P11836 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MS4A1P11836 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MS4A1P11836 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MS4A1P11836 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MS4A1P11836 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MS4A1P11836 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MS4A1P11836 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MS4A1P11836 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MS4A1P11836 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MS4A1P11836 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MS4A1P11836 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MS4A1P11836 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MS4A1P11836 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MS4A1P11836 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MS4A1P11836 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MS4A1P11836 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MS4A1P11836 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MS4A1P11836 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MS4A1P11836 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MS4A1P11836 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MS4A1P11836 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MS4A1P11836 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
MS4A1P11836 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MS4A1P11836 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MS4A1P11836 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MS4A1P11836 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MS4A1P11836 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MS4A1P11836 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MS4A1P11836 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MS4A1P11836 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MS4A1P11836 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MS4A1P11836 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MS4A1P11836 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MS4A1P11836 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MS4A1P11836 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms