Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms