Protein–RNA interactions for Protein: O75533

SF3B1, Splicing factor 3B subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B1O75533 RAP2C-205ENST00000620646 3341 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.861e-6■■■■■ 110.3
SF3B1O75533 ECI2-204ENST00000380125 1405 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.143e-21■■■■■ 110.3
SF3B1O75533 ECI2-206ENST00000464583 3870 ntTSL 26.63□□□□□ -1.353e-21■■■■■ 110.3
SF3B1O75533 HPCAL1-205ENST00000423674 586 ntTSL 425.08■■□□□ 1.64e-6■■■■■ 110.3
SF3B1O75533 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.144e-6■■■■■ 110.3
SF3B1O75533 HSPG2-203ENST00000374695 14327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.012e-6■■■■■ 110.2
SF3B1O75533 PRR5-213ENST00000492289 735 ntTSL 320.7■□□□□ 0.92e-6■■■■■ 110.2
SF3B1O75533 PRR5-206ENST00000432186 905 ntTSL 219.78■□□□□ 0.762e-6■■■■■ 110.2
SF3B1O75533 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.413e-6■■■■■ 110.2
SF3B1O75533 PRR5-214ENST00000492475 920 ntTSL 515.59■□□□□ 0.092e-6■■■■■ 110.2
SF3B1O75533 LTBP4-223ENST00000598717 811 ntTSL 520.65■□□□□ 0.92e-6■■■■■ 110.1
SF3B1O75533 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.324e-6■■■■■ 110.1
SF3B1O75533 KCNMB2-AS1-202ENST00000425330 508 ntTSL 311.96□□□□□ -0.492e-6■■■■■ 110
SF3B1O75533 KCNMB2-AS1-204ENST00000437488 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.712e-6■■■■■ 110
SF3B1O75533 KCNMB2-AS1-205ENST00000451742 844 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.52e-6■■■■■ 110
SF3B1O75533 KCNMB2-AS1-203ENST00000432385 516 ntTSL 32.48□□□□□ -2.012e-6■■■■■ 110
SF3B1O75533 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.394e-6■■■■■ 110
SF3B1O75533 CPVL-201ENST00000265394 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.394e-6■■■■■ 110
SF3B1O75533 CPVL-207ENST00000448959 874 ntTSL 212.41□□□□□ -0.424e-6■■■■■ 110
SF3B1O75533 CPVL-203ENST00000409850 2213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.694e-6■■■■■ 110
SF3B1O75533 CPVL-206ENST00000447426 553 ntTSL 56.46□□□□□ -1.384e-6■■■■■ 110
SF3B1O75533 HUWE1-202ENST00000262854 14739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.714e-6■■■■■ 110
SF3B1O75533 HUWE1-203ENST00000342160 14796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.244e-6■■■■■ 110
SF3B1O75533 HUWE1-214ENST00000612484 14311 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.494e-6■■■■■ 110
SF3B1O75533 MACROD1-208ENST00000545464 899 ntTSL 327.19■■□□□ 1.942e-6■■■■■ 110
SF3B1O75533 MACROD1-206ENST00000542359 459 ntTSL 317.17■□□□□ 0.342e-6■■■■■ 110
SF3B1O75533 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.383e-6■■■■■ 110
SF3B1O75533 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.323e-6■■■■■ 110
SF3B1O75533 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.133e-6■■■■■ 110
SF3B1O75533 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.143e-6■■■■■ 110
SF3B1O75533 NFATC2-202ENST00000396009 7437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.253e-6■■■■■ 110
SF3B1O75533 NFATC2-201ENST00000371564 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.33e-6■■■■■ 110
SF3B1O75533 TAL1-203ENST00000459729 1796 ntTSL 1 (best)25.33■■□□□ 1.652e-7■■■■■ 109.9
SF3B1O75533 KIFC3-227ENST00000566914 724 ntTSL 324.42■■□□□ 1.52e-7■■■■■ 109.9
SF3B1O75533 AGPAT3-210ENST00000457068 924 ntTSL 317.47■□□□□ 0.394e-7■■■■■ 109.9
SF3B1O75533 CTIF-205ENST00000587860 2940 ntTSL 215.15■□□□□ 0.024e-7■■■■■ 109.9
SF3B1O75533 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.112e-6■■■■■ 109.9
SF3B1O75533 AGPAT3-217ENST00000498670 791 ntTSL 313.68□□□□□ -0.224e-7■■■■■ 109.9
SF3B1O75533 AGPAT3-203ENST00000398058 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.464e-7■■■■■ 109.9
SF3B1O75533 IFT80-201ENST00000326448 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.494e-7■■■■■ 109.9
SF3B1O75533 AGPAT3-209ENST00000448845 392 ntTSL 511.51□□□□□ -0.574e-7■■■■■ 109.9
SF3B1O75533 IFT80-225ENST00000496589 3073 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.264e-7■■■■■ 109.9
SF3B1O75533 IFT80-223ENST00000487943 3893 ntTSL 26.96□□□□□ -1.34e-7■■■■■ 109.9
SF3B1O75533 GMPS-202ENST00000476145 570 ntTSL 45.36□□□□□ -1.554e-7■■■■■ 109.9
SF3B1O75533 PTPN4-203ENST00000430976 4154 ntTSL 55.09□□□□□ -1.594e-7■■■■■ 109.9
SF3B1O75533 IFT80-220ENST00000483465 4044 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.764e-7■■■■■ 109.9
SF3B1O75533 IFT80-216ENST00000478460 591 ntTSL 43.59□□□□□ -1.834e-7■■■■■ 109.9
SF3B1O75533 PTPN4-205ENST00000433888 954 ntTSL 32.2□□□□□ -2.064e-7■■■■■ 109.9
SF3B1O75533 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.152e-7■■■■■ 109.9
SF3B1O75533 CCDC144NL-AS1-201ENST00000417232 709 ntTSL 35.94□□□□□ -1.462e-7■■■■■ 109.9
SF3B1O75533 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 02e-6■■■■■ 109.8
SF3B1O75533 UBA1-203ENST00000377351 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.882e-6■■■■■ 109.8
SF3B1O75533 SPIDR-212ENST00000519661 1035 ntTSL 212.55□□□□□ -0.43e-8■■■■■ 109.8
SF3B1O75533 SPIDR-222ENST00000524006 970 ntTSL 511.14□□□□□ -0.633e-8■■■■■ 109.8
SF3B1O75533 SPIDR-223ENST00000524033 1023 ntTSL 28.01□□□□□ -1.133e-8■■■■■ 109.8
SF3B1O75533 KLHL18-204ENST00000442272 2249 ntTSL 214.51□□□□□ -0.092e-6■■■■■ 109.8
SF3B1O75533 KLHL18-201ENST00000232766 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.712e-6■■■■■ 109.8
SF3B1O75533 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.286e-6■■■■■ 109.8
SF3B1O75533 ST6GAL1-216ENST00000458216 507 ntTSL 313.85□□□□□ -0.193e-6■■■■■ 109.7
SF3B1O75533 ST6GAL1-206ENST00000430309 504 ntTSL 49.32□□□□□ -0.923e-6■■■■■ 109.7
SF3B1O75533 ST6GAL1-203ENST00000417392 707 ntTSL 28.84□□□□□ -0.993e-6■■■■■ 109.7
SF3B1O75533 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.882e-6■■■■■ 109.7
SF3B1O75533 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.832e-6■■■■■ 109.7
SF3B1O75533 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.642e-6■■■■■ 109.7
SF3B1O75533 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.592e-6■■■■■ 109.7
SF3B1O75533 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.572e-6■■■■■ 109.7
SF3B1O75533 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.472e-6■■■■■ 109.7
SF3B1O75533 PCCB-217ENST00000484181 1683 ntTSL 317.21■□□□□ 0.352e-6■■■■■ 109.7
SF3B1O75533 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.282e-6■■■■■ 109.7
SF3B1O75533 PCCB-212ENST00000474833 921 ntTSL 516.4■□□□□ 0.222e-6■■■■■ 109.7
SF3B1O75533 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.192e-6■■■■■ 109.7
SF3B1O75533 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.082e-6■■■■■ 109.7
SF3B1O75533 PCCB-211ENST00000473073 1964 ntTSL 213.3□□□□□ -0.282e-6■■■■■ 109.7
SF3B1O75533 PCCB-210ENST00000471595 6090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.322e-6■■■■■ 109.7
SF3B1O75533 PCCB-214ENST00000478469 4502 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.42e-6■■■■■ 109.7
SF3B1O75533 DVL1-205ENST00000631679 778 ntTSL 512.54□□□□□ -0.42e-6■■■■■ 109.7
SF3B1O75533 PCCB-213ENST00000475214 1295 ntTSL 210.65□□□□□ -0.72e-6■■■■■ 109.7
SF3B1O75533 ZNF618-206ENST00000481558 1126 ntTSL 518.95■□□□□ 0.623e-6■■■■■ 109.7
SF3B1O75533 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.413e-6■■■■■ 109.7
SF3B1O75533 ZNF618-202ENST00000374124 1156 ntTSL 515.84■□□□□ 0.133e-6■■■■■ 109.7
SF3B1O75533 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.063e-6■■■■■ 109.7
SF3B1O75533 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.063e-6■■■■■ 109.7
SF3B1O75533 ZNF618-204ENST00000452710 942 ntTSL 514.05□□□□□ -0.163e-6■■■■■ 109.7
SF3B1O75533 RAF1-203ENST00000423275 2354 ntTSL 219.14■□□□□ 0.653e-6■■■■■ 109.7
SF3B1O75533 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.073e-6■■■■■ 109.7
SF3B1O75533 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -03e-6■■■■■ 109.7
SF3B1O75533 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.086e-7■■■■■ 109.6
SF3B1O75533 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.086e-7■■■■■ 109.6
SF3B1O75533 ABCC1-205ENST00000574224 1543 ntTSL 1 (best)12.82□□□□□ -0.366e-7■■■■■ 109.6
SF3B1O75533 RPTOR-211ENST00000577161 3633 ntTSL 211.36□□□□□ -0.595e-6■■■■■ 109.6
SF3B1O75533 ABCC1-204ENST00000572882 4565 ntTSL 1 (best)10.07□□□□□ -0.86e-7■■■■■ 109.6
SF3B1O75533 UBE3A-222ENST00000630907 889 ntTSL 528.08■■■□□ 2.096e-7■■■■■ 109.6
SF3B1O75533 UBE3A-213ENST00000626793 733 ntTSL 525.02■■□□□ 1.66e-7■■■■■ 109.6
SF3B1O75533 UBE3A-218ENST00000629252 1112 ntTSL 522.57■■□□□ 1.26e-7■■■■■ 109.6
SF3B1O75533 UBE3A-215ENST00000628267 779 ntTSL 522.28■■□□□ 1.166e-7■■■■■ 109.6
SF3B1O75533 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.476e-7■■■■■ 109.6
SF3B1O75533 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.156e-7■■■■■ 109.6
SF3B1O75533 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.086e-7■■■■■ 109.6
SF3B1O75533 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.066e-7■■■■■ 109.6
SF3B1O75533 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.096e-7■■■■■ 109.6
Retrieved 100 of 46,956 protein–RNA pairs in 1350.5 ms