Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F3O00716 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F3O00716 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F3O00716 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F3O00716 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F3O00716 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F3O00716 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F3O00716 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F3O00716 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F3O00716 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F3O00716 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F3O00716 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F3O00716 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F3O00716 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F3O00716 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F3O00716 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2F3O00716 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
E2F3O00716 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
E2F3O00716 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
E2F3O00716 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
E2F3O00716 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F3O00716 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F3O00716 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F3O00716 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F3O00716 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F3O00716 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F3O00716 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F3O00716 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F3O00716 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F3O00716 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F3O00716 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F3O00716 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F3O00716 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F3O00716 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F3O00716 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F3O00716 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F3O00716 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F3O00716 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F3O00716 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F3O00716 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F3O00716 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F3O00716 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F3O00716 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F3O00716 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F3O00716 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F3O00716 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F3O00716 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F3O00716 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F3O00716 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F3O00716 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F3O00716 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F3O00716 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F3O00716 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F3O00716 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F3O00716 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F3O00716 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F3O00716 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F3O00716 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F3O00716 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F3O00716 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F3O00716 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F3O00716 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F3O00716 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F3O00716 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F3O00716 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F3O00716 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F3O00716 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F3O00716 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F3O00716 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F3O00716 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F3O00716 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F3O00716 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F3O00716 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2F3O00716 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F3O00716 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F3O00716 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F3O00716 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F3O00716 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F3O00716 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F3O00716 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F3O00716 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F3O00716 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F3O00716 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F3O00716 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F3O00716 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F3O00716 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F3O00716 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F3O00716 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F3O00716 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F3O00716 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F3O00716 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F3O00716 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F3O00716 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F3O00716 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F3O00716 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F3O00716 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2F3O00716 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F3O00716 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F3O00716 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F3O00716 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms