Protein–RNA interactions for Protein: A8MVJ9

Putative histone PARylation factor 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A8MVJ9 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
A8MVJ9 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
A8MVJ9 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
A8MVJ9 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
A8MVJ9 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
A8MVJ9 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
A8MVJ9 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
A8MVJ9 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
A8MVJ9 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
A8MVJ9 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
A8MVJ9 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
A8MVJ9 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
A8MVJ9 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
A8MVJ9 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
A8MVJ9 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
A8MVJ9 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
A8MVJ9 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
A8MVJ9 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
A8MVJ9 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
A8MVJ9 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
A8MVJ9 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
A8MVJ9 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
A8MVJ9 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
A8MVJ9 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
A8MVJ9 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
A8MVJ9 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
A8MVJ9 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
A8MVJ9 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
A8MVJ9 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
A8MVJ9 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
A8MVJ9 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
A8MVJ9 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
A8MVJ9 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
A8MVJ9 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
A8MVJ9 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
A8MVJ9 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
A8MVJ9 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
A8MVJ9 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
A8MVJ9 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
A8MVJ9 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
A8MVJ9 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
A8MVJ9 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
A8MVJ9 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
A8MVJ9 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
A8MVJ9 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
A8MVJ9 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
A8MVJ9 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
A8MVJ9 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
A8MVJ9 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
A8MVJ9 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
A8MVJ9 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
A8MVJ9 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
A8MVJ9 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
A8MVJ9 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
A8MVJ9 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
A8MVJ9 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
A8MVJ9 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
A8MVJ9 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
A8MVJ9 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
A8MVJ9 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
A8MVJ9 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
A8MVJ9 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
A8MVJ9 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
A8MVJ9 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
A8MVJ9 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
A8MVJ9 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
A8MVJ9 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
A8MVJ9 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
A8MVJ9 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
A8MVJ9 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
A8MVJ9 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
A8MVJ9 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
A8MVJ9 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
A8MVJ9 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
A8MVJ9 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
A8MVJ9 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
A8MVJ9 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
A8MVJ9 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
A8MVJ9 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
A8MVJ9 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
A8MVJ9 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
A8MVJ9 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
A8MVJ9 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
A8MVJ9 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
A8MVJ9 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
A8MVJ9 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
A8MVJ9 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
A8MVJ9 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
A8MVJ9 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
A8MVJ9 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
A8MVJ9 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
A8MVJ9 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
A8MVJ9 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
A8MVJ9 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
A8MVJ9 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
A8MVJ9 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
A8MVJ9 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
A8MVJ9 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
A8MVJ9 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
A8MVJ9 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms