Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NOTOA8MTQ0 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms