Protein–RNA interactions for Protein: A6NCE7

MAP1LC3B2, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3 beta 2, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3B2A6NCE7 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms