Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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SH3BP1Q9Y3L3 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
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SH3BP1Q9Y3L3 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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SH3BP1Q9Y3L3 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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SH3BP1Q9Y3L3 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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SH3BP1Q9Y3L3 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
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