Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2F8

SIPA1L2, Signal-induced proliferation-associated 1-like protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIPA1L2Q9P2F8 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIPA1L2Q9P2F8 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SIPA1L2Q9P2F8 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIPA1L2Q9P2F8 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIPA1L2Q9P2F8 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIPA1L2Q9P2F8 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SIPA1L2Q9P2F8 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIPA1L2Q9P2F8 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIPA1L2Q9P2F8 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIPA1L2Q9P2F8 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIPA1L2Q9P2F8 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIPA1L2Q9P2F8 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIPA1L2Q9P2F8 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIPA1L2Q9P2F8 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIPA1L2Q9P2F8 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIPA1L2Q9P2F8 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIPA1L2Q9P2F8 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIPA1L2Q9P2F8 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIPA1L2Q9P2F8 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIPA1L2Q9P2F8 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIPA1L2Q9P2F8 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIPA1L2Q9P2F8 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIPA1L2Q9P2F8 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SIPA1L2Q9P2F8 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIPA1L2Q9P2F8 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIPA1L2Q9P2F8 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIPA1L2Q9P2F8 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIPA1L2Q9P2F8 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIPA1L2Q9P2F8 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIPA1L2Q9P2F8 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SIPA1L2Q9P2F8 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIPA1L2Q9P2F8 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIPA1L2Q9P2F8 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIPA1L2Q9P2F8 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIPA1L2Q9P2F8 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SIPA1L2Q9P2F8 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIPA1L2Q9P2F8 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIPA1L2Q9P2F8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIPA1L2Q9P2F8 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIPA1L2Q9P2F8 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIPA1L2Q9P2F8 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIPA1L2Q9P2F8 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIPA1L2Q9P2F8 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIPA1L2Q9P2F8 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIPA1L2Q9P2F8 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIPA1L2Q9P2F8 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIPA1L2Q9P2F8 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SIPA1L2Q9P2F8 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SIPA1L2Q9P2F8 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIPA1L2Q9P2F8 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIPA1L2Q9P2F8 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIPA1L2Q9P2F8 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIPA1L2Q9P2F8 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIPA1L2Q9P2F8 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIPA1L2Q9P2F8 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIPA1L2Q9P2F8 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIPA1L2Q9P2F8 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIPA1L2Q9P2F8 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIPA1L2Q9P2F8 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIPA1L2Q9P2F8 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIPA1L2Q9P2F8 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIPA1L2Q9P2F8 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIPA1L2Q9P2F8 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SIPA1L2Q9P2F8 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIPA1L2Q9P2F8 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIPA1L2Q9P2F8 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIPA1L2Q9P2F8 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIPA1L2Q9P2F8 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIPA1L2Q9P2F8 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIPA1L2Q9P2F8 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIPA1L2Q9P2F8 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIPA1L2Q9P2F8 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIPA1L2Q9P2F8 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIPA1L2Q9P2F8 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIPA1L2Q9P2F8 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIPA1L2Q9P2F8 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIPA1L2Q9P2F8 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIPA1L2Q9P2F8 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIPA1L2Q9P2F8 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIPA1L2Q9P2F8 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIPA1L2Q9P2F8 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SIPA1L2Q9P2F8 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SIPA1L2Q9P2F8 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SIPA1L2Q9P2F8 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SIPA1L2Q9P2F8 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
SIPA1L2Q9P2F8 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SIPA1L2Q9P2F8 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
SIPA1L2Q9P2F8 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SIPA1L2Q9P2F8 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
SIPA1L2Q9P2F8 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SIPA1L2Q9P2F8 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SIPA1L2Q9P2F8 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SIPA1L2Q9P2F8 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SIPA1L2Q9P2F8 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
SIPA1L2Q9P2F8 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SIPA1L2Q9P2F8 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SIPA1L2Q9P2F8 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SIPA1L2Q9P2F8 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SIPA1L2Q9P2F8 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SIPA1L2Q9P2F8 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms