Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW5

CLN6, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6Q9NWW5 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLN6Q9NWW5 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms