Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I1

MTMR12, Myotubularin-related protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR12Q9C0I1 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms