Protein–RNA interactions for Protein: Q99963

SH3GL3, Endophilin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL3Q99963 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SH3GL3Q99963 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SH3GL3Q99963 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SH3GL3Q99963 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SH3GL3Q99963 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3GL3Q99963 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3GL3Q99963 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3GL3Q99963 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3GL3Q99963 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3GL3Q99963 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3GL3Q99963 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3GL3Q99963 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3GL3Q99963 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3GL3Q99963 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3GL3Q99963 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3GL3Q99963 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3GL3Q99963 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3GL3Q99963 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3GL3Q99963 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3GL3Q99963 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3GL3Q99963 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3GL3Q99963 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3GL3Q99963 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3GL3Q99963 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3GL3Q99963 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3GL3Q99963 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3GL3Q99963 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3GL3Q99963 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3GL3Q99963 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3GL3Q99963 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3GL3Q99963 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3GL3Q99963 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3GL3Q99963 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3GL3Q99963 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3GL3Q99963 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3GL3Q99963 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3GL3Q99963 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3GL3Q99963 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3GL3Q99963 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3GL3Q99963 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3GL3Q99963 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3GL3Q99963 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3GL3Q99963 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3GL3Q99963 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3GL3Q99963 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SH3GL3Q99963 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3GL3Q99963 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3GL3Q99963 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3GL3Q99963 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3GL3Q99963 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3GL3Q99963 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3GL3Q99963 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3GL3Q99963 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3GL3Q99963 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3GL3Q99963 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3GL3Q99963 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3GL3Q99963 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3GL3Q99963 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3GL3Q99963 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3GL3Q99963 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3GL3Q99963 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3GL3Q99963 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3GL3Q99963 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3GL3Q99963 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3GL3Q99963 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3GL3Q99963 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3GL3Q99963 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3GL3Q99963 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3GL3Q99963 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3GL3Q99963 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3GL3Q99963 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3GL3Q99963 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3GL3Q99963 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3GL3Q99963 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3GL3Q99963 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3GL3Q99963 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3GL3Q99963 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3GL3Q99963 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3GL3Q99963 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3GL3Q99963 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3GL3Q99963 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3GL3Q99963 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3GL3Q99963 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3GL3Q99963 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3GL3Q99963 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3GL3Q99963 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3GL3Q99963 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3GL3Q99963 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3GL3Q99963 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3GL3Q99963 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3GL3Q99963 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SH3GL3Q99963 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3GL3Q99963 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3GL3Q99963 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3GL3Q99963 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3GL3Q99963 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3GL3Q99963 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3GL3Q99963 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3GL3Q99963 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3GL3Q99963 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms