Protein–RNA interactions for Protein: Q96NW4

ANKRD27, Ankyrin repeat domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 1,050 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD27Q96NW4 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD27Q96NW4 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms