Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RABGGTAQ92696 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RABGGTAQ92696 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RABGGTAQ92696 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RABGGTAQ92696 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RABGGTAQ92696 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RABGGTAQ92696 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
RABGGTAQ92696 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
RABGGTAQ92696 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RABGGTAQ92696 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RABGGTAQ92696 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RABGGTAQ92696 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RABGGTAQ92696 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RABGGTAQ92696 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
RABGGTAQ92696 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RABGGTAQ92696 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RABGGTAQ92696 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RABGGTAQ92696 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RABGGTAQ92696 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RABGGTAQ92696 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RABGGTAQ92696 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RABGGTAQ92696 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RABGGTAQ92696 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RABGGTAQ92696 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RABGGTAQ92696 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RABGGTAQ92696 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RABGGTAQ92696 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RABGGTAQ92696 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RABGGTAQ92696 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RABGGTAQ92696 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RABGGTAQ92696 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RABGGTAQ92696 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RABGGTAQ92696 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
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RABGGTAQ92696 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RABGGTAQ92696 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RABGGTAQ92696 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
RABGGTAQ92696 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RABGGTAQ92696 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RABGGTAQ92696 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
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RABGGTAQ92696 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RABGGTAQ92696 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
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RABGGTAQ92696 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
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RABGGTAQ92696 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
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RABGGTAQ92696 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
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RABGGTAQ92696 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RABGGTAQ92696 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RABGGTAQ92696 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RABGGTAQ92696 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
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RABGGTAQ92696 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RABGGTAQ92696 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RABGGTAQ92696 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RABGGTAQ92696 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RABGGTAQ92696 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RABGGTAQ92696 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RABGGTAQ92696 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RABGGTAQ92696 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RABGGTAQ92696 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RABGGTAQ92696 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RABGGTAQ92696 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RABGGTAQ92696 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RABGGTAQ92696 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RABGGTAQ92696 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
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