Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF64

GIPC3, PDZ domain-containing protein GIPC3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC3Q8TF64 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GIPC3Q8TF64 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms