Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDC3

BRSK1, Serine/threonine-protein kinase BRSK1, humanhuman

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRSK1Q8TDC3 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRSK1Q8TDC3 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRSK1Q8TDC3 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRSK1Q8TDC3 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRSK1Q8TDC3 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRSK1Q8TDC3 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRSK1Q8TDC3 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRSK1Q8TDC3 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRSK1Q8TDC3 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRSK1Q8TDC3 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRSK1Q8TDC3 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRSK1Q8TDC3 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRSK1Q8TDC3 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
BRSK1Q8TDC3 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRSK1Q8TDC3 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRSK1Q8TDC3 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRSK1Q8TDC3 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRSK1Q8TDC3 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRSK1Q8TDC3 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRSK1Q8TDC3 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
BRSK1Q8TDC3 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRSK1Q8TDC3 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
BRSK1Q8TDC3 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRSK1Q8TDC3 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRSK1Q8TDC3 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRSK1Q8TDC3 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRSK1Q8TDC3 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRSK1Q8TDC3 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRSK1Q8TDC3 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRSK1Q8TDC3 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRSK1Q8TDC3 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRSK1Q8TDC3 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRSK1Q8TDC3 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRSK1Q8TDC3 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRSK1Q8TDC3 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRSK1Q8TDC3 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRSK1Q8TDC3 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRSK1Q8TDC3 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRSK1Q8TDC3 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRSK1Q8TDC3 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRSK1Q8TDC3 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRSK1Q8TDC3 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRSK1Q8TDC3 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRSK1Q8TDC3 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRSK1Q8TDC3 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRSK1Q8TDC3 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRSK1Q8TDC3 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
BRSK1Q8TDC3 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRSK1Q8TDC3 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRSK1Q8TDC3 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRSK1Q8TDC3 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
BRSK1Q8TDC3 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRSK1Q8TDC3 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRSK1Q8TDC3 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRSK1Q8TDC3 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
BRSK1Q8TDC3 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRSK1Q8TDC3 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRSK1Q8TDC3 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRSK1Q8TDC3 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRSK1Q8TDC3 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRSK1Q8TDC3 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRSK1Q8TDC3 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRSK1Q8TDC3 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRSK1Q8TDC3 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRSK1Q8TDC3 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRSK1Q8TDC3 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRSK1Q8TDC3 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRSK1Q8TDC3 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRSK1Q8TDC3 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRSK1Q8TDC3 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRSK1Q8TDC3 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRSK1Q8TDC3 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRSK1Q8TDC3 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRSK1Q8TDC3 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRSK1Q8TDC3 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRSK1Q8TDC3 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRSK1Q8TDC3 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRSK1Q8TDC3 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRSK1Q8TDC3 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRSK1Q8TDC3 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRSK1Q8TDC3 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
BRSK1Q8TDC3 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRSK1Q8TDC3 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRSK1Q8TDC3 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRSK1Q8TDC3 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRSK1Q8TDC3 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRSK1Q8TDC3 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRSK1Q8TDC3 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRSK1Q8TDC3 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRSK1Q8TDC3 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRSK1Q8TDC3 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRSK1Q8TDC3 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRSK1Q8TDC3 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRSK1Q8TDC3 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRSK1Q8TDC3 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRSK1Q8TDC3 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRSK1Q8TDC3 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
BRSK1Q8TDC3 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRSK1Q8TDC3 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRSK1Q8TDC3 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms