Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms