Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3A8

PARP8, Poly [ADP-ribose] polymerase 8, humanhuman

Predictions only

Length 854 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP8Q8N3A8 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PARP8Q8N3A8 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PARP8Q8N3A8 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PARP8Q8N3A8 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PARP8Q8N3A8 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PARP8Q8N3A8 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PARP8Q8N3A8 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PARP8Q8N3A8 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PARP8Q8N3A8 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PARP8Q8N3A8 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PARP8Q8N3A8 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PARP8Q8N3A8 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PARP8Q8N3A8 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PARP8Q8N3A8 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PARP8Q8N3A8 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PARP8Q8N3A8 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PARP8Q8N3A8 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PARP8Q8N3A8 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PARP8Q8N3A8 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PARP8Q8N3A8 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PARP8Q8N3A8 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PARP8Q8N3A8 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PARP8Q8N3A8 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PARP8Q8N3A8 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PARP8Q8N3A8 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PARP8Q8N3A8 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PARP8Q8N3A8 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PARP8Q8N3A8 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PARP8Q8N3A8 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PARP8Q8N3A8 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PARP8Q8N3A8 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PARP8Q8N3A8 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
PARP8Q8N3A8 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PARP8Q8N3A8 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PARP8Q8N3A8 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PARP8Q8N3A8 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PARP8Q8N3A8 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PARP8Q8N3A8 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PARP8Q8N3A8 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PARP8Q8N3A8 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PARP8Q8N3A8 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PARP8Q8N3A8 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PARP8Q8N3A8 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PARP8Q8N3A8 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PARP8Q8N3A8 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PARP8Q8N3A8 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PARP8Q8N3A8 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PARP8Q8N3A8 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PARP8Q8N3A8 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PARP8Q8N3A8 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PARP8Q8N3A8 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PARP8Q8N3A8 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PARP8Q8N3A8 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PARP8Q8N3A8 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PARP8Q8N3A8 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PARP8Q8N3A8 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PARP8Q8N3A8 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PARP8Q8N3A8 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PARP8Q8N3A8 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PARP8Q8N3A8 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PARP8Q8N3A8 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PARP8Q8N3A8 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PARP8Q8N3A8 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PARP8Q8N3A8 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PARP8Q8N3A8 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PARP8Q8N3A8 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PARP8Q8N3A8 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PARP8Q8N3A8 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PARP8Q8N3A8 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PARP8Q8N3A8 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PARP8Q8N3A8 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PARP8Q8N3A8 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PARP8Q8N3A8 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PARP8Q8N3A8 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PARP8Q8N3A8 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PARP8Q8N3A8 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PARP8Q8N3A8 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PARP8Q8N3A8 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PARP8Q8N3A8 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PARP8Q8N3A8 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PARP8Q8N3A8 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PARP8Q8N3A8 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PARP8Q8N3A8 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PARP8Q8N3A8 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PARP8Q8N3A8 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PARP8Q8N3A8 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PARP8Q8N3A8 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PARP8Q8N3A8 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PARP8Q8N3A8 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PARP8Q8N3A8 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PARP8Q8N3A8 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PARP8Q8N3A8 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PARP8Q8N3A8 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PARP8Q8N3A8 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PARP8Q8N3A8 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PARP8Q8N3A8 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PARP8Q8N3A8 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PARP8Q8N3A8 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PARP8Q8N3A8 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PARP8Q8N3A8 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms