Protein–RNA interactions for Protein: Q86U86

PBRM1, Protein polybromo-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1Q86U86 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PBRM1Q86U86 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PBRM1Q86U86 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PBRM1Q86U86 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PBRM1Q86U86 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PBRM1Q86U86 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PBRM1Q86U86 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PBRM1Q86U86 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PBRM1Q86U86 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PBRM1Q86U86 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PBRM1Q86U86 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PBRM1Q86U86 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PBRM1Q86U86 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
PBRM1Q86U86 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PBRM1Q86U86 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PBRM1Q86U86 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PBRM1Q86U86 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PBRM1Q86U86 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PBRM1Q86U86 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PBRM1Q86U86 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PBRM1Q86U86 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PBRM1Q86U86 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PBRM1Q86U86 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PBRM1Q86U86 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PBRM1Q86U86 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PBRM1Q86U86 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
PBRM1Q86U86 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PBRM1Q86U86 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PBRM1Q86U86 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PBRM1Q86U86 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
PBRM1Q86U86 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PBRM1Q86U86 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PBRM1Q86U86 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PBRM1Q86U86 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PBRM1Q86U86 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PBRM1Q86U86 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
PBRM1Q86U86 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PBRM1Q86U86 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PBRM1Q86U86 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PBRM1Q86U86 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PBRM1Q86U86 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PBRM1Q86U86 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PBRM1Q86U86 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
PBRM1Q86U86 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PBRM1Q86U86 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PBRM1Q86U86 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PBRM1Q86U86 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PBRM1Q86U86 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PBRM1Q86U86 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PBRM1Q86U86 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
PBRM1Q86U86 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
PBRM1Q86U86 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PBRM1Q86U86 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PBRM1Q86U86 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PBRM1Q86U86 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PBRM1Q86U86 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PBRM1Q86U86 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PBRM1Q86U86 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PBRM1Q86U86 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PBRM1Q86U86 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PBRM1Q86U86 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PBRM1Q86U86 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PBRM1Q86U86 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PBRM1Q86U86 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PBRM1Q86U86 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PBRM1Q86U86 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PBRM1Q86U86 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PBRM1Q86U86 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PBRM1Q86U86 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PBRM1Q86U86 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PBRM1Q86U86 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PBRM1Q86U86 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
PBRM1Q86U86 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PBRM1Q86U86 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PBRM1Q86U86 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PBRM1Q86U86 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PBRM1Q86U86 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PBRM1Q86U86 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PBRM1Q86U86 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PBRM1Q86U86 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PBRM1Q86U86 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PBRM1Q86U86 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PBRM1Q86U86 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PBRM1Q86U86 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
PBRM1Q86U86 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PBRM1Q86U86 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PBRM1Q86U86 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PBRM1Q86U86 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PBRM1Q86U86 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PBRM1Q86U86 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PBRM1Q86U86 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PBRM1Q86U86 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PBRM1Q86U86 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PBRM1Q86U86 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PBRM1Q86U86 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PBRM1Q86U86 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
PBRM1Q86U86 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
PBRM1Q86U86 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PBRM1Q86U86 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PBRM1Q86U86 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.5 ms