Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT89

TRNP1, TMF-regulated nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1Q6NT89 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRNP1Q6NT89 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.1 ms