Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms