Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CSPP1Q1MSJ5 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms