Protein–RNA interactions for Protein: Q16820

MEP1B, Meprin A subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEP1BQ16820 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MEP1BQ16820 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MEP1BQ16820 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MEP1BQ16820 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MEP1BQ16820 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MEP1BQ16820 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MEP1BQ16820 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MEP1BQ16820 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MEP1BQ16820 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MEP1BQ16820 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MEP1BQ16820 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MEP1BQ16820 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MEP1BQ16820 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MEP1BQ16820 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MEP1BQ16820 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MEP1BQ16820 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MEP1BQ16820 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MEP1BQ16820 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MEP1BQ16820 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MEP1BQ16820 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MEP1BQ16820 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MEP1BQ16820 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MEP1BQ16820 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MEP1BQ16820 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MEP1BQ16820 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MEP1BQ16820 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MEP1BQ16820 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MEP1BQ16820 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MEP1BQ16820 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MEP1BQ16820 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MEP1BQ16820 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MEP1BQ16820 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MEP1BQ16820 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MEP1BQ16820 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
MEP1BQ16820 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MEP1BQ16820 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MEP1BQ16820 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MEP1BQ16820 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
MEP1BQ16820 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MEP1BQ16820 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MEP1BQ16820 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MEP1BQ16820 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MEP1BQ16820 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MEP1BQ16820 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
MEP1BQ16820 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MEP1BQ16820 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MEP1BQ16820 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MEP1BQ16820 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MEP1BQ16820 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MEP1BQ16820 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MEP1BQ16820 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MEP1BQ16820 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MEP1BQ16820 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MEP1BQ16820 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MEP1BQ16820 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MEP1BQ16820 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MEP1BQ16820 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MEP1BQ16820 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MEP1BQ16820 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MEP1BQ16820 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MEP1BQ16820 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MEP1BQ16820 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MEP1BQ16820 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
MEP1BQ16820 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MEP1BQ16820 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MEP1BQ16820 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MEP1BQ16820 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
MEP1BQ16820 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MEP1BQ16820 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MEP1BQ16820 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MEP1BQ16820 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MEP1BQ16820 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MEP1BQ16820 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MEP1BQ16820 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MEP1BQ16820 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MEP1BQ16820 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MEP1BQ16820 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MEP1BQ16820 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MEP1BQ16820 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MEP1BQ16820 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MEP1BQ16820 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MEP1BQ16820 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MEP1BQ16820 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MEP1BQ16820 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MEP1BQ16820 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MEP1BQ16820 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MEP1BQ16820 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MEP1BQ16820 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MEP1BQ16820 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MEP1BQ16820 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MEP1BQ16820 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MEP1BQ16820 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MEP1BQ16820 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MEP1BQ16820 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
MEP1BQ16820 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MEP1BQ16820 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MEP1BQ16820 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MEP1BQ16820 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MEP1BQ16820 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MEP1BQ16820 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms