Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDK4Q16654 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
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