Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NTRK3Q16288 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
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