Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
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GRIK4Q16099 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
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GRIK4Q16099 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
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GRIK4Q16099 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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GRIK4Q16099 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
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GRIK4Q16099 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIK4Q16099 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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