Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
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SYCP1Q15431 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
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SYCP1Q15431 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
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SYCP1Q15431 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
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SYCP1Q15431 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SYCP1Q15431 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
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SYCP1Q15431 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
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