Protein–RNA interactions for Protein: Q149M9

NWD1, NACHT domain- and WD repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NWD1Q149M9 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NWD1Q149M9 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NWD1Q149M9 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NWD1Q149M9 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NWD1Q149M9 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NWD1Q149M9 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NWD1Q149M9 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NWD1Q149M9 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NWD1Q149M9 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NWD1Q149M9 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NWD1Q149M9 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NWD1Q149M9 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NWD1Q149M9 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NWD1Q149M9 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NWD1Q149M9 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NWD1Q149M9 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NWD1Q149M9 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NWD1Q149M9 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NWD1Q149M9 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NWD1Q149M9 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NWD1Q149M9 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NWD1Q149M9 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NWD1Q149M9 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NWD1Q149M9 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NWD1Q149M9 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NWD1Q149M9 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NWD1Q149M9 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NWD1Q149M9 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NWD1Q149M9 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NWD1Q149M9 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NWD1Q149M9 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NWD1Q149M9 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NWD1Q149M9 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NWD1Q149M9 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NWD1Q149M9 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NWD1Q149M9 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NWD1Q149M9 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NWD1Q149M9 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NWD1Q149M9 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NWD1Q149M9 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NWD1Q149M9 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NWD1Q149M9 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NWD1Q149M9 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NWD1Q149M9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NWD1Q149M9 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NWD1Q149M9 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NWD1Q149M9 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NWD1Q149M9 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NWD1Q149M9 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NWD1Q149M9 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NWD1Q149M9 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NWD1Q149M9 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NWD1Q149M9 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NWD1Q149M9 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NWD1Q149M9 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NWD1Q149M9 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NWD1Q149M9 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NWD1Q149M9 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NWD1Q149M9 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NWD1Q149M9 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NWD1Q149M9 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NWD1Q149M9 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NWD1Q149M9 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NWD1Q149M9 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NWD1Q149M9 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NWD1Q149M9 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NWD1Q149M9 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NWD1Q149M9 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NWD1Q149M9 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NWD1Q149M9 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NWD1Q149M9 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NWD1Q149M9 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NWD1Q149M9 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NWD1Q149M9 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NWD1Q149M9 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NWD1Q149M9 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NWD1Q149M9 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NWD1Q149M9 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NWD1Q149M9 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NWD1Q149M9 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NWD1Q149M9 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NWD1Q149M9 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NWD1Q149M9 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NWD1Q149M9 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NWD1Q149M9 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NWD1Q149M9 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NWD1Q149M9 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NWD1Q149M9 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NWD1Q149M9 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NWD1Q149M9 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NWD1Q149M9 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NWD1Q149M9 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NWD1Q149M9 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NWD1Q149M9 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NWD1Q149M9 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NWD1Q149M9 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NWD1Q149M9 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NWD1Q149M9 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NWD1Q149M9 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NWD1Q149M9 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms