Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms