Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
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