Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GPS1Q13098 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
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