Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHRNB3Q05901 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNB3Q05901 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms