Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TFAMQ00059 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms