Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ACTBP60709 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ACTBP60709 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ACTBP60709 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ACTBP60709 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
ACTBP60709 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
ACTBP60709 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
ACTBP60709 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ACTBP60709 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ACTBP60709 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ACTBP60709 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
ACTBP60709 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ACTBP60709 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ACTBP60709 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ACTBP60709 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ACTBP60709 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ACTBP60709 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ACTBP60709 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ACTBP60709 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ACTBP60709 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ACTBP60709 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ACTBP60709 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
ACTBP60709 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
ACTBP60709 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
ACTBP60709 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ACTBP60709 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ACTBP60709 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ACTBP60709 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
ACTBP60709 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ACTBP60709 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
ACTBP60709 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ACTBP60709 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ACTBP60709 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
ACTBP60709 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ACTBP60709 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
ACTBP60709 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
ACTBP60709 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ACTBP60709 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ACTBP60709 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
ACTBP60709 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ACTBP60709 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
ACTBP60709 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ACTBP60709 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ACTBP60709 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ACTBP60709 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ACTBP60709 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ACTBP60709 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ACTBP60709 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ACTBP60709 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ACTBP60709 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
ACTBP60709 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ACTBP60709 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ACTBP60709 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ACTBP60709 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ACTBP60709 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ACTBP60709 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
ACTBP60709 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ACTBP60709 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ACTBP60709 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ACTBP60709 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ACTBP60709 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ACTBP60709 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ACTBP60709 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ACTBP60709 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ACTBP60709 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ACTBP60709 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ACTBP60709 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ACTBP60709 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ACTBP60709 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ACTBP60709 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ACTBP60709 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ACTBP60709 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ACTBP60709 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ACTBP60709 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ACTBP60709 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ACTBP60709 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACTBP60709 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACTBP60709 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACTBP60709 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACTBP60709 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ACTBP60709 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACTBP60709 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACTBP60709 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACTBP60709 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACTBP60709 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACTBP60709 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACTBP60709 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACTBP60709 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACTBP60709 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACTBP60709 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACTBP60709 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACTBP60709 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACTBP60709 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACTBP60709 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACTBP60709 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACTBP60709 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACTBP60709 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACTBP60709 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACTBP60709 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ACTBP60709 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms