Protein–RNA interactions for Protein: P49257

LMAN1, Protein ERGIC-53, humanhuman

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN1P49257 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMAN1P49257 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMAN1P49257 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMAN1P49257 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMAN1P49257 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMAN1P49257 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMAN1P49257 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMAN1P49257 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMAN1P49257 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMAN1P49257 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMAN1P49257 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMAN1P49257 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMAN1P49257 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMAN1P49257 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMAN1P49257 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMAN1P49257 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMAN1P49257 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMAN1P49257 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMAN1P49257 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMAN1P49257 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMAN1P49257 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMAN1P49257 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMAN1P49257 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMAN1P49257 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMAN1P49257 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMAN1P49257 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMAN1P49257 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMAN1P49257 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMAN1P49257 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMAN1P49257 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMAN1P49257 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMAN1P49257 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMAN1P49257 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMAN1P49257 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMAN1P49257 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
LMAN1P49257 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMAN1P49257 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMAN1P49257 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMAN1P49257 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMAN1P49257 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMAN1P49257 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMAN1P49257 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
LMAN1P49257 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMAN1P49257 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMAN1P49257 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMAN1P49257 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMAN1P49257 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMAN1P49257 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMAN1P49257 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
LMAN1P49257 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMAN1P49257 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMAN1P49257 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMAN1P49257 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMAN1P49257 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMAN1P49257 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMAN1P49257 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
LMAN1P49257 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMAN1P49257 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMAN1P49257 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMAN1P49257 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
LMAN1P49257 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMAN1P49257 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMAN1P49257 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMAN1P49257 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMAN1P49257 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMAN1P49257 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMAN1P49257 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMAN1P49257 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMAN1P49257 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMAN1P49257 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMAN1P49257 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMAN1P49257 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMAN1P49257 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMAN1P49257 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMAN1P49257 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMAN1P49257 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LMAN1P49257 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMAN1P49257 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
LMAN1P49257 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMAN1P49257 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMAN1P49257 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMAN1P49257 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMAN1P49257 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMAN1P49257 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMAN1P49257 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
LMAN1P49257 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMAN1P49257 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMAN1P49257 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMAN1P49257 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMAN1P49257 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMAN1P49257 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMAN1P49257 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMAN1P49257 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
LMAN1P49257 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMAN1P49257 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMAN1P49257 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMAN1P49257 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMAN1P49257 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMAN1P49257 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMAN1P49257 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms