Protein–RNA interactions for Protein: P24522

GADD45A, Growth arrest and DNA damage-inducible protein GADD45 alpha, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45AP24522 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GADD45AP24522 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms