Protein–RNA interactions for Protein: P20337

RAB3B, Ras-related protein Rab-3B, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3BP20337 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB3BP20337 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RAB3BP20337 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RAB3BP20337 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB3BP20337 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB3BP20337 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB3BP20337 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB3BP20337 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB3BP20337 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB3BP20337 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB3BP20337 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB3BP20337 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB3BP20337 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB3BP20337 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB3BP20337 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB3BP20337 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB3BP20337 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB3BP20337 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB3BP20337 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB3BP20337 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB3BP20337 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB3BP20337 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB3BP20337 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB3BP20337 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB3BP20337 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB3BP20337 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB3BP20337 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB3BP20337 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB3BP20337 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB3BP20337 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB3BP20337 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB3BP20337 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB3BP20337 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB3BP20337 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB3BP20337 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB3BP20337 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB3BP20337 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RAB3BP20337 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB3BP20337 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB3BP20337 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB3BP20337 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB3BP20337 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB3BP20337 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB3BP20337 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB3BP20337 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB3BP20337 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB3BP20337 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB3BP20337 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB3BP20337 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB3BP20337 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB3BP20337 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB3BP20337 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB3BP20337 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB3BP20337 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB3BP20337 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB3BP20337 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB3BP20337 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB3BP20337 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB3BP20337 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB3BP20337 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB3BP20337 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB3BP20337 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RAB3BP20337 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RAB3BP20337 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
RAB3BP20337 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RAB3BP20337 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RAB3BP20337 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RAB3BP20337 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RAB3BP20337 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
RAB3BP20337 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
RAB3BP20337 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
RAB3BP20337 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RAB3BP20337 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB3BP20337 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB3BP20337 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB3BP20337 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB3BP20337 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB3BP20337 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB3BP20337 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB3BP20337 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB3BP20337 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB3BP20337 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RAB3BP20337 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB3BP20337 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB3BP20337 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RAB3BP20337 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB3BP20337 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB3BP20337 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB3BP20337 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB3BP20337 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB3BP20337 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB3BP20337 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB3BP20337 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB3BP20337 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB3BP20337 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB3BP20337 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB3BP20337 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB3BP20337 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB3BP20337 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB3BP20337 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms