Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C4BP0C0L5 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C4BP0C0L5 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C4BP0C0L5 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C4BP0C0L5 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C4BP0C0L5 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
C4BP0C0L5 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
C4BP0C0L5 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
C4BP0C0L5 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
C4BP0C0L5 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
C4BP0C0L5 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C4BP0C0L5 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C4BP0C0L5 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C4BP0C0L5 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C4BP0C0L5 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C4BP0C0L5 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C4BP0C0L5 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
C4BP0C0L5 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C4BP0C0L5 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C4BP0C0L5 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C4BP0C0L5 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C4BP0C0L5 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
C4BP0C0L5 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C4BP0C0L5 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
C4BP0C0L5 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C4BP0C0L5 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C4BP0C0L5 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C4BP0C0L5 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C4BP0C0L5 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C4BP0C0L5 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C4BP0C0L5 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C4BP0C0L5 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C4BP0C0L5 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C4BP0C0L5 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C4BP0C0L5 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C4BP0C0L5 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C4BP0C0L5 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C4BP0C0L5 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C4BP0C0L5 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
C4BP0C0L5 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C4BP0C0L5 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C4BP0C0L5 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C4BP0C0L5 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C4BP0C0L5 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C4BP0C0L5 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C4BP0C0L5 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C4BP0C0L5 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C4BP0C0L5 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C4BP0C0L5 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C4BP0C0L5 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C4BP0C0L5 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C4BP0C0L5 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C4BP0C0L5 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C4BP0C0L5 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
C4BP0C0L5 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C4BP0C0L5 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C4BP0C0L5 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C4BP0C0L5 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C4BP0C0L5 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
C4BP0C0L5 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C4BP0C0L5 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C4BP0C0L5 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C4BP0C0L5 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C4BP0C0L5 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C4BP0C0L5 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C4BP0C0L5 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C4BP0C0L5 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
C4BP0C0L5 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
C4BP0C0L5 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
C4BP0C0L5 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C4BP0C0L5 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C4BP0C0L5 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C4BP0C0L5 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C4BP0C0L5 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C4BP0C0L5 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C4BP0C0L5 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C4BP0C0L5 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C4BP0C0L5 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C4BP0C0L5 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C4BP0C0L5 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C4BP0C0L5 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C4BP0C0L5 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C4BP0C0L5 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C4BP0C0L5 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
C4BP0C0L5 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C4BP0C0L5 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C4BP0C0L5 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C4BP0C0L5 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C4BP0C0L5 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C4BP0C0L5 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C4BP0C0L5 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C4BP0C0L5 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C4BP0C0L5 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C4BP0C0L5 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C4BP0C0L5 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C4BP0C0L5 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C4BP0C0L5 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C4BP0C0L5 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C4BP0C0L5 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C4BP0C0L5 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms