Protein–RNA interactions for Protein: P08238

HSP90AB1, Heat shock protein HSP 90-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AB1P08238 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
HSP90AB1P08238 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HSP90AB1P08238 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HSP90AB1P08238 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HSP90AB1P08238 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HSP90AB1P08238 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HSP90AB1P08238 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HSP90AB1P08238 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HSP90AB1P08238 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HSP90AB1P08238 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HSP90AB1P08238 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HSP90AB1P08238 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HSP90AB1P08238 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HSP90AB1P08238 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HSP90AB1P08238 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HSP90AB1P08238 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HSP90AB1P08238 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HSP90AB1P08238 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HSP90AB1P08238 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HSP90AB1P08238 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HSP90AB1P08238 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HSP90AB1P08238 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HSP90AB1P08238 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HSP90AB1P08238 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HSP90AB1P08238 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HSP90AB1P08238 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HSP90AB1P08238 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HSP90AB1P08238 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HSP90AB1P08238 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HSP90AB1P08238 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HSP90AB1P08238 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HSP90AB1P08238 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HSP90AB1P08238 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HSP90AB1P08238 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HSP90AB1P08238 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HSP90AB1P08238 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HSP90AB1P08238 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HSP90AB1P08238 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HSP90AB1P08238 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HSP90AB1P08238 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HSP90AB1P08238 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HSP90AB1P08238 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HSP90AB1P08238 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HSP90AB1P08238 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HSP90AB1P08238 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HSP90AB1P08238 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HSP90AB1P08238 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HSP90AB1P08238 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HSP90AB1P08238 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HSP90AB1P08238 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HSP90AB1P08238 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HSP90AB1P08238 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HSP90AB1P08238 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HSP90AB1P08238 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HSP90AB1P08238 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HSP90AB1P08238 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HSP90AB1P08238 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HSP90AB1P08238 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms