Protein–RNA interactions for Protein: P05408

SCG5, Neuroendocrine protein 7B2, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG5P05408 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCG5P05408 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCG5P05408 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCG5P05408 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCG5P05408 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCG5P05408 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCG5P05408 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SCG5P05408 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCG5P05408 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCG5P05408 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SCG5P05408 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SCG5P05408 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCG5P05408 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCG5P05408 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCG5P05408 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCG5P05408 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCG5P05408 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCG5P05408 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCG5P05408 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCG5P05408 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCG5P05408 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCG5P05408 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCG5P05408 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCG5P05408 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCG5P05408 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCG5P05408 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCG5P05408 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCG5P05408 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCG5P05408 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCG5P05408 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCG5P05408 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCG5P05408 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCG5P05408 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCG5P05408 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCG5P05408 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCG5P05408 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCG5P05408 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCG5P05408 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCG5P05408 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCG5P05408 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCG5P05408 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCG5P05408 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCG5P05408 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCG5P05408 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCG5P05408 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCG5P05408 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCG5P05408 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCG5P05408 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCG5P05408 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCG5P05408 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCG5P05408 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCG5P05408 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCG5P05408 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCG5P05408 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCG5P05408 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCG5P05408 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCG5P05408 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SCG5P05408 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCG5P05408 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SCG5P05408 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCG5P05408 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCG5P05408 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SCG5P05408 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SCG5P05408 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCG5P05408 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCG5P05408 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCG5P05408 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCG5P05408 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCG5P05408 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCG5P05408 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCG5P05408 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCG5P05408 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCG5P05408 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCG5P05408 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCG5P05408 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCG5P05408 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SCG5P05408 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCG5P05408 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCG5P05408 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCG5P05408 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCG5P05408 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCG5P05408 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCG5P05408 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCG5P05408 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SCG5P05408 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SCG5P05408 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SCG5P05408 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SCG5P05408 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCG5P05408 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCG5P05408 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCG5P05408 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCG5P05408 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCG5P05408 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCG5P05408 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCG5P05408 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SCG5P05408 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SCG5P05408 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCG5P05408 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCG5P05408 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCG5P05408 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms