Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SETD1BQ9UPS6 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SETD1BQ9UPS6 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SETD1BQ9UPS6 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SETD1BQ9UPS6 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SETD1BQ9UPS6 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SETD1BQ9UPS6 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SETD1BQ9UPS6 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SETD1BQ9UPS6 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SETD1BQ9UPS6 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SETD1BQ9UPS6 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SETD1BQ9UPS6 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SETD1BQ9UPS6 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SETD1BQ9UPS6 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SETD1BQ9UPS6 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SETD1BQ9UPS6 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SETD1BQ9UPS6 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SETD1BQ9UPS6 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SETD1BQ9UPS6 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SETD1BQ9UPS6 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SETD1BQ9UPS6 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SETD1BQ9UPS6 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SETD1BQ9UPS6 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SETD1BQ9UPS6 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SETD1BQ9UPS6 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SETD1BQ9UPS6 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SETD1BQ9UPS6 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SETD1BQ9UPS6 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SETD1BQ9UPS6 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SETD1BQ9UPS6 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SETD1BQ9UPS6 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SETD1BQ9UPS6 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SETD1BQ9UPS6 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SETD1BQ9UPS6 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SETD1BQ9UPS6 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SETD1BQ9UPS6 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SETD1BQ9UPS6 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SETD1BQ9UPS6 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SETD1BQ9UPS6 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SETD1BQ9UPS6 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SETD1BQ9UPS6 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SETD1BQ9UPS6 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SETD1BQ9UPS6 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SETD1BQ9UPS6 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SETD1BQ9UPS6 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SETD1BQ9UPS6 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SETD1BQ9UPS6 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SETD1BQ9UPS6 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SETD1BQ9UPS6 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SETD1BQ9UPS6 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SETD1BQ9UPS6 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SETD1BQ9UPS6 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SETD1BQ9UPS6 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SETD1BQ9UPS6 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SETD1BQ9UPS6 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SETD1BQ9UPS6 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SETD1BQ9UPS6 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SETD1BQ9UPS6 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SETD1BQ9UPS6 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SETD1BQ9UPS6 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SETD1BQ9UPS6 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SETD1BQ9UPS6 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SETD1BQ9UPS6 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SETD1BQ9UPS6 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SETD1BQ9UPS6 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SETD1BQ9UPS6 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SETD1BQ9UPS6 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SETD1BQ9UPS6 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SETD1BQ9UPS6 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SETD1BQ9UPS6 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SETD1BQ9UPS6 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SETD1BQ9UPS6 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SETD1BQ9UPS6 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SETD1BQ9UPS6 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SETD1BQ9UPS6 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SETD1BQ9UPS6 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SETD1BQ9UPS6 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SETD1BQ9UPS6 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SETD1BQ9UPS6 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SETD1BQ9UPS6 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SETD1BQ9UPS6 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SETD1BQ9UPS6 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SETD1BQ9UPS6 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SETD1BQ9UPS6 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SETD1BQ9UPS6 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SETD1BQ9UPS6 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SETD1BQ9UPS6 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SETD1BQ9UPS6 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SETD1BQ9UPS6 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SETD1BQ9UPS6 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SETD1BQ9UPS6 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SETD1BQ9UPS6 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SETD1BQ9UPS6 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SETD1BQ9UPS6 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SETD1BQ9UPS6 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SETD1BQ9UPS6 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SETD1BQ9UPS6 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SETD1BQ9UPS6 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SETD1BQ9UPS6 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SETD1BQ9UPS6 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.4 ms