Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK13

ZNF221, Zinc finger protein 221, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF221Q9UK13 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF221Q9UK13 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF221Q9UK13 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF221Q9UK13 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF221Q9UK13 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF221Q9UK13 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF221Q9UK13 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF221Q9UK13 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF221Q9UK13 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF221Q9UK13 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF221Q9UK13 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF221Q9UK13 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF221Q9UK13 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF221Q9UK13 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF221Q9UK13 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF221Q9UK13 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF221Q9UK13 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF221Q9UK13 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF221Q9UK13 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF221Q9UK13 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF221Q9UK13 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF221Q9UK13 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF221Q9UK13 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF221Q9UK13 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF221Q9UK13 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF221Q9UK13 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF221Q9UK13 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF221Q9UK13 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF221Q9UK13 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF221Q9UK13 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF221Q9UK13 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF221Q9UK13 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF221Q9UK13 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF221Q9UK13 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF221Q9UK13 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF221Q9UK13 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF221Q9UK13 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF221Q9UK13 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF221Q9UK13 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF221Q9UK13 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF221Q9UK13 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF221Q9UK13 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF221Q9UK13 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF221Q9UK13 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF221Q9UK13 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF221Q9UK13 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF221Q9UK13 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF221Q9UK13 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF221Q9UK13 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF221Q9UK13 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF221Q9UK13 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF221Q9UK13 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF221Q9UK13 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF221Q9UK13 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF221Q9UK13 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF221Q9UK13 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF221Q9UK13 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF221Q9UK13 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF221Q9UK13 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF221Q9UK13 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF221Q9UK13 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF221Q9UK13 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF221Q9UK13 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF221Q9UK13 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF221Q9UK13 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF221Q9UK13 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF221Q9UK13 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF221Q9UK13 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF221Q9UK13 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF221Q9UK13 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF221Q9UK13 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF221Q9UK13 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF221Q9UK13 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF221Q9UK13 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF221Q9UK13 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF221Q9UK13 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF221Q9UK13 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF221Q9UK13 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF221Q9UK13 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF221Q9UK13 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF221Q9UK13 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF221Q9UK13 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF221Q9UK13 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF221Q9UK13 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF221Q9UK13 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF221Q9UK13 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF221Q9UK13 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF221Q9UK13 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF221Q9UK13 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF221Q9UK13 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF221Q9UK13 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF221Q9UK13 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF221Q9UK13 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF221Q9UK13 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF221Q9UK13 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF221Q9UK13 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF221Q9UK13 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF221Q9UK13 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF221Q9UK13 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF221Q9UK13 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms